coverage,生物测序中的de novo genome assembly是什么意思还有coverage

大家好,今天来为大家分享coverage的一些知识点,和生物测序中的de novo genome assembly是什么意思还有coverage的问题解析,大家要是都明白,那么可以忽略,如果不太清楚的话可以看看本篇文章,相信很大概率可以解决您的问题,接下来我们就一起来看看吧!

coverage什么意思

coverage

n.范围,规模;保险项目;(新闻)报导;[植]优势度

双语例句

1.NowaspecialTVnetworkgiveslivecoverageofmostraces.

现在有一个专门的电视网络对大部分比赛进行现场直播。

2.Underhiseditorship,theEconomisthasintroducedregularsportscoverage.

在他担任编辑期间,《经济家》开始定期刊登体育报道。

3.Newspapers,televisionandradioareallprovidingsaturationcoverage.

报纸、电视和电台全都在铺天盖地地报道。

4.DevelopmentsinSouthAfricareceiveextensivecoverageinTheSundayTelegraph.

《星期日电讯报》全面报道了南非的发展。

5.Mostmediacoveragedisapprovesofthetravellers’lifestyleandvalues.

大多数媒体报道都不赞成那些旅行者的生活方式和价值观。

groove coverage中文是什么意思,有什么含义

groove本意是槽,沟,车辙的意思coverage本意是保险项目,保险范围,新闻报道(范围)的意思groovecoverage一般叫舞动精灵王族,是德国新晋乐队.2002年出道,两人组合,主唱:verena(女)1984年5月14日出生纽博格DJ及创作:DJNOVUS。原名MARKUSSCHAFFARZYK。1976年11月7日出生。

生物测序中的de novo genome assembly是什么意思还有coverage

denovoassembly是新的基因组装配,(denovo的意思是全新,assembly是序列拼接),即在没有参考序列的情况下进行序列拼接,对未知基因组序列进行测序,利用生物信息学分析手段,对序列进行拼接、组装,从而获得其基因组的图谱。但这是个相对的概念,比如如果有了人类基因组作参考,那拼chimpanzee的就不是denovo,而算abinitio。

此外还会有人对测序的覆盖度(coverage)和测序的深度(depth)概念混淆。

对于coverage,由于大片段拼接的gap(空白或者缺口)、测序读长有限、重复序列等问题的存在,测序分析后组装得到的基因组序列通常无法完全覆盖所有区域,覆盖度就是最终得到的结果占整个基因组的比例。例如一个人的基因组测序,覆盖度为98.5%,那么说明该基因组还有1.5%的区域通过我们的组装和分析无法得到;

对于depth,就是被测基因组上单个碱基被测序的平均次数,比如某样本的测序深度为30X,那么就是说该样本的基因组上每一个单碱基平均被测序(或者说读取)了30次,注意,是平均。当然了,depth也有最大和最小值,这个都可以由信息分析得到。其实也就是为了提高准确率什么的,一般15X就差不多了。

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